バイオバンク・ジャパンとは
公開済解析データ
制限公開
データID | 内容 | 人数 | 公開日 |
---|---|---|---|
JGAS000101 | 心房細動患者8,180症例のPhenotypeデータ、Genotypeデータ | 8,180 | 2017/5/18 |
JGAS000114 | BBJ第一コホートBMIデータ、90万SNP Genotypeデータ | 158,284(BMI) 182,505(SNP) | 2017/9/8 |
JGAS000114 | 58臨床検査値のPhenotypeデータ | 162,255 | 2018/5/1 |
JGAS000114 | BBJ第一コホートWGSデータ | 1,026 | 2018/8/13 |
JGAS000140 | 遺伝性乳がん原因11遺伝子翻訳領域の Target CaptureSequencingデータ | 30,825 | 2018/10/16 |
JGAS000114 | genotype imputation用のreference panel | 3,541 | 2019/9/27 |
JGAS000203 | 遺伝性前立腺がん原因8遺伝子翻訳領域の TargetCapture Sequencingデータ | 20,002 | 2019/10/7 |
JGAS000293 | 2003年から2007年度にバイオバンク・ジャパンに登録されたサンプル (約20万例)から抽出された11,234名の23遺伝子における 全てのエクソン領域のTarget Capture Sequencingn解析より得られた 体細胞変異データおよびSNPアレイにより得られた染色体変異データ | 11,234 | 2021/5/21 |
JGAS000114 にデータ追加 | JGAD000220のWGSデータのbam/gvcfデータ | 1,026 | 2021/07/13 |
JGAS000327 | 膵がん1,005症例の遺伝性腫瘍関連27遺伝子翻訳領域の Target Capture Sequencingデータ | 1,005 | 2021/11/26 |
JGAS000346 | 大腸がん12,503症例および対照者23,705名の 遺伝性腫瘍関連27遺伝子翻訳領域のTarget Capture Sequencingデータ | 36,208 | 2021/11/26 |
JGAS000381 | 心筋梗塞1,765症例、認知症199症例のWGSデータ | 1,964 | 2022/1/25 |
JGAS000414 | 腎がん740症例および対照者5,996名の遺伝性腫瘍関連27遺伝子 および腎がん関連13遺伝子翻訳領域のTarget Capture Sequencing データ | 6,736 | 2022/4/1 |
JGAS000347 | リンパ腫1,982症例の遺伝性腫瘍関連27遺伝子翻訳領域の Target Capture Sequencingデータ | 1,982 | 2023/4/20 |
JGAS000592 | 胃がん10,366症例の遺伝性腫瘍関連27遺伝子翻訳領域の Target Capture Sequencingデータ | 10,366 | 2023/4/20 |
JGAS000592 | 対照者37,592名(BBJの非がん対象者)の遺伝性腫瘍関連27遺伝子 翻訳領域のTarget Capture Sequencingデータ | 37,592 | 2023/4/20 |
データID | 内容 | 人数 | 公開日 |
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JGAS000018 | HLA領域(7座位)の遺伝子型情報およびHLAアリル情報 | 908 | 2015/6/2 |
JGAS000018 | HLA-DQA1領域の遺伝子型情報およびHLA-DQA1 アリル情報の追加 | 908 | 2018/6/5 |
データID | 内容 | 人数 | 公開日 |
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JGAS000240 | NGS(WGS)に内在するHHV-6配列 | 10 | 2020/7/28 |
データID | 内容 | 人数 | 公開日 |
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JGAS000412 | BBJ第一コホート11,716名、 BBJ第二コホート42,689名のGenotypeデータ | BBJ第一コホート(47疾患):11,716名 BBJ第二コホート(38疾患):42,689名 | 2021/11/30 |
JGAS000541 | BBJ第一コホート180,882名を男女別に7つのバッチに 分けて実施したImputationデータならびにindexデータ | BBJ第一コホート(47疾患):180,882名 | 2022/07/28 |
JGAS000561 | BBJ第一コホート1,285名の血清サンプルを対象とした NMRによるメタボロームデータ | BBJ第一コホート(47疾患):1,285名 | 2022/09/08 |
JGAS000561 (データ追加) | BBJ第一コホート1,285名の血清サンプルを対象とした NMRによるメタボロームデータ | BBJ第一コホート(47疾患): 1,285名+2,570名 累計:3,841名 同一人物で複数検体がありますので、 合計と累計が違います | 2023/04/24 |
制限共有
制限共有(AGD)
データID | 内容 | 人数 | 公開日 |
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AGDS_00000000005 | バイオバンク・ジャパン登録患者のWGSデータ (心筋梗塞、胃がん、認知症) | 2,219 | 2019/7/23 |
AGDS_00000000009 | バイオバンク・ジャパン登録患者のWGSデータ(47疾患) | 1,007 | 2021/7/30 |
AGDS_000005 (データ追加) | WGSデータのbam/gvcfデータ | 胃がん(ICD10:C16): 255症例 | 2022/02/01 |
非制限公開
データID | 内容 | 公開日 |
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hum0014.v1.freq.v1 | 心筋梗塞1,666症例および対照健常者3,198名のGWAS | 2014/9/30 |
hum0014.v2.jsnp. 934ctrl.v1 | 健常者934名35疾患各約190症例の遺伝子型カウント情報 | 2015/12/28 |
35疾患 | 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報(JSNPのデータ) | 2015/12/28 |
hum0014.v2.jsnp. 182ec.v1 | 食道がん182症例の遺伝子型カウント情報(JSNPのデータ) | 2015/12/28 |
hum0014.v2.jsnp. 92als.v1 | 筋萎縮性側索硬化症92症例の遺伝子型カウント情報(JSNPのデータ) | 2015/12/28 |
hum0014.v3. T2DM-1.v1 | 2型糖尿病9,817症例および対照者6,763名のGWAS | 2016/1/28 |
hum0014.v3. T2DM-2.v1 | 2型糖尿病5,646症例および対照者19,420名のGWAS | 2016/1/28 |
hum0014.v4.AD.v1 | アトピー性皮膚炎患者1,472症例および対照者7,966名のGWAS | 2016/2/2 |
hum0014.v5.AF.v1 | 心房細動患者8,180症例および対照者28,612名のGWAS | 2017/5/18 |
hum0014.v6.158k.v1 | 158,284名のBMIのGWAS | 2017/9/8 |
hum0014.v7.POAG.v1 | 開放隅角緑内障3,980症例および対照者18,815名のGWAS | 2018/4/4 |
hum0014.v8.58qt.v1 | 162,255名の58臨床検査値のGWAS | 2018/5/1 |
hum0014.v9.Men.v1 hum0014.v9.MP.v1 | 初潮年齢データを有する女性67,029名および 閉経年齢データを有する女性43,861名のGWAS | 2018/8/7 |
hum0014.v12. T2DMwN.v1 | 2型糖尿病腎症2,809症例および2型糖尿病対照5,592症例のGWASメタ解析 | 2018/12/10 |
hum0014.v13. T2DMmeta.v1 | 2型糖尿病36,614症例および対照者155,150名のGWASメタ解析 | 2019/1/25 |
hum0014.v14. smok.v1 | 日本人集団165,436名における喫煙習慣のGWAS | 2019/3/26 |
hum0014.v15.ht.v1 | 159,095名の身長のGWAS | 2019/9/27 |
hum0014.v17 | 40疾患のGWAS | 2019/10/8 |
hum0014.v18 | 乳がんのGWAS | 2019/11/26 |
hum0014.v19 | 日本人集団165,084名における食習慣のGWAS | 2020/4/20 |
hum0014.v20.cad.v1 | 冠動脈疾患のGWAS | 2020/8/17 |
hum0014.v21 | 虚血性心疾患のGWAS | 2020/8/25 |
JGAS000293 | 2003年から2007年度にバイオバンク・ジャパンに登録されたサンプル(約20万例)から 抽出された11,234名の23遺伝子における全てのエクソン領域の Target Capture Sequencingn解析より得られた体細胞変異データおよび SNPアレイにより得られた染色体変異データ | 2021/5/21 |
JGAS000114 にデータ追加 | JGAD000220のWGSデータのbam/gvcfデータ | 2021/7/13 |
JGAS000327 | 膵がん1,005症例の遺伝性腫瘍関連27遺伝子翻訳領域の Target Capture Sequencingデータ | 2021/11/26 |
JGAS000346 | 大腸がん12,503症例および対照者23,705名の遺伝性腫瘍関連27遺伝子翻訳領域の Target Capture Sequencingデータ | 2021/11/26 |
JGAS000381 | 心筋梗塞1,765症例、認知症199症例のWGSデータ | 2022/1/25 |
JGAS000414 | 腎がん740症例および対照者5,996名の遺伝性腫瘍関連27遺伝子および 腎がん関連13遺伝子翻訳領域のTarget Capture Sequencingデータ | 2022/4/1 |
hum0014.v27.surv.v1 | BBJ第1コホート137,693名の生存に関するGWAS | 2022/12/31 |
hum0014.v28.MEs.v1 | BBJ第1コホート4,880名のmobile element多型頻度情報 | 2023/4/5 |
hum0014.v29.AF.v1 | 心房細動患者9,826症例および対照者140,446名のGWAS(BBJ) 心房細動患者77,690症例および対照者1,167,040名のGWASメタ解析 (BBJ、欧米人、FinnGen) | 2023/4/5 |
JGAS000347 | リンパ腫1,982症例の遺伝性腫瘍関連27遺伝子翻訳領域の Target Capture Sequencingデータ | 2023/4/20 |
JGAS000592 | 胃がん10,366症例の遺伝性腫瘍関連27遺伝子翻訳領域の Target Capture Sequencingデータ | 2023/4/20 |
JGAS000592 | 対照者37,592名(BBJの非がん対象者)の遺伝性腫瘍関連27遺伝子翻訳領域の Target Capture Sequencingデータ | 2023/4/20 |