疾患等の進行状況を示すために使用される物質や特性のこと。生体内で観察され、測定可能な何かしらの指標であり、医学や生命科学の分野で幅広く利用されている。
例えば、特定のタンパク質、遺伝子、ホルモン、代謝物質（代謝産物）などがバイオマーカーとなり得る。これらのバイオマーカーは、病気の早期診断、進行のモニタリング、治療効果の評価など、医学的な診断や治療において非常に重要な役割を果たす。