対照群とは生き物を対象にした研究で、比較対照のために設けるグループのこと。たとえば薬の効果を確かめる実験であれば、薬を使うグループと使わないグループを設け、後者が対照群となる。このサイトでおもに扱う「症例対照研究」では、研究の対象とする病気にかかったことのない集団を対照群とする。症例対照研究は、病気の原因をさかのぼって調べる研究方法で、調べたい病気にかかっている集団とその病気にかかったことのない集団の特性 を比較することによって、病気と関連する要因を探す。調べたい病気にかかっている集団は、症例群と呼ばれる。

BBJは患者を対象としたバイオバンクのため、BBJの研究協力者のみで症例対照研究を行う場合は、研究対象の病気で登録されている研究協力者の集団を症例群、その病気の登録がなく、 かつかかったことがない研究協力者の集団を対照群として、病気に関係する遺伝的な要因などについて検討される。研究によっては、症例群をBBJの研究協力者から選び、対照群を他のコホート研究などに参加している健康な人から選ぶことがある。